Il titolo di activision permette di creare un avatar virtuale molto personalizzabile, con cui affrontare lo story mode e incontrare i personaggi del manga. Il gioco si sviluppa in arene tridimensionali con aree anche segrete, all'inizio dello scontro si lancia la sfera che rappresenta il Bakugan e la si può muovere liberamente per l'arena, dandoci la possibilità di raccogliere dei punti G. Aumentando la nostra riserva di questo elemento potremo semplificare le battaglie tra bakugan. Quando la sfera colpisce la carta al centro dell'arena il turno di gioco passa all'altro giocatore, al momento in cui il suo Bakugan arriva sulla carta dove vi è il nostro, parte lo scontro. Le sfere dei due robot si aprono liberando le forme reali delle bestie, a quel punto si gira la carta, sulla quale sono segnati i G degli elementi. Questi aumentano il potere, o lo diminuiscono, dei nostri Bakugan. Oltre a questa influenza si possono usare delle carte secondarie per aumentare ancora la forza del nostro robot, utilizzando queste carte si passa a un sottogioco con il controller della console. Oltre alla modalità Story in cui si avanza sconfiggendo nelle arene i nemici, si può affrontare una modalità versus battle libera.